Сергій Перун народився 31 грудня 1982 року у місті Хмельницькому.
Навчався у Хмельницькій спеціалізованій загальноосвітній школі № 8. Після її закінчення вступив до Хмельницького професійно-технічного училища № 11, де освоїв професію автослюсаря. Деякий час працював автослюсарем, а згодом плиточником-облицювальником та майстром з оздоблювальних робіт. Мав «золоті руки», умів виконувати будь-яку роботу.
Добровольцем пішов захищати Україну 24 лютого 2023 року. Служив у складі окремого гірсько-штурмового батальйону, був гранатометником, командиром штурмової групи.